Nová technika odhaluje, jak virus Zika interaguje uvnitř našich buněk

Volkswagen Touareg Night Vision - TopSpeed.sk (Smět 2019).

Anonim

Vědci vyvinuli novou techniku, která dokáže určit, jak viry interagují s hostitelskou vlastní RNA. Stejně jako poskytování vhledů na to, jak viry řídí hostitelskou buňku k vytvoření nových virových částic, by tato technika, publikovaná v Nature Methods, mohla umožnit výzkumníkům navrhnout umělé molekuly schopné blokovat proces replikace viru a zabránit šíření viru.

RNA viry jsou často považovány za největší hrozbu pro vyvolání celosvětové pandemie. Při neexistenci účinných a dostupných vakcín nebo léků mají onemocnění způsobená RNA virem, jako je virus Ebola, virus Zika a koronavirus SARS, významný dopad na veřejné zdraví, zatímco viry napadující prasata způsobují těžké ztráty chovu prasat. Mezitím se stále objevují nové RNA viry kvůli jejich rychlému vývoji.

RNA viry jsou tak nazvané, protože používají RNA místo DNA k reprezentaci svého genetického kódu. Jejich genom kóduje proteiny a interaguje s hostitelskými buňkami. Dosud však struktura virových RNA genomů, zatímco uvnitř hostitelské buňky byla velmi neznámá.

Vědci z University of Cambridge vyvinuli novou techniku, která určuje strukturu a interakce genomu Zika v lidských buňkách. Tato technika se nazývá COMRADES (Crosslink of Matched RNAs a Deep Sequencing) a je důležité, že může být aplikována na jakýkoliv virus RNA v jakékoliv hostitelské buňce. Podrobné informace odvozené od společnosti COMRADES nabízejí možnost navrhnout novou generaci léků, které působí blokováním interakce RNA mezi hostitelem hostitele a hostitele nebo interferováním s nezbytnými strukturami virového genomu.

Naše vlastní buňky také obsahují RNA, ať už jde o "messenger RNA" kódující proteiny nebo "nekódující RNA", které regulují různé aspekty buněčné funkce. Infekční cyklus RNA virů se odehrává hlavně v buněčné cytoplazmě, kde sídlí řada našich RNA. Molekuly virové a hostitelské RNA mohou interagovat přímo pomocí "párování bází" podél částí jejich struktury - jinými slovy, vytvářet sérii vazeb pro zip obou molekul dohromady. Tyto interakce nabízejí potenciální cíle pro antivirové terapie a ve skutečnosti je lék proti viru hepatitidy C, který se zaměřuje na takovou interakci hostitele-virové RNA, Miraversen, v současnosti v pokročilých klinických studiích.

Nicméně prevalence přirozeně se vyskytujícího párování hostitelských virových RNA není známa a objevy nových interakcí jsou vzácné. Nová technologie COMRADES, vyvinutá Dr. Omerem Zivem ve výzkumném středisku Wellcome Trust / Cancer Research UK Gurdon Institute s mezinárodním týmem kolegů, může prověřit párování hostitelského viru RNA a odhalit interakční sekvence RNA v jediném experimentu.

Dr. Ziv a jeho spolupracovníci použili metodu COMRADES k vyšetření genomu Zika viru uvnitř lidských buněk, což odhalilo jeho strukturu i mnohočetné interakce s lidskými regulačními nekódujícími RNA, jako jsou mikroRNA, přenosové RNA a malé jaderné RNA. S novou technikou se odhalí jak totožnost, tak pozice každé páry základů, která poskytuje nezbytné a dostatečné informace pro navrhování doplňkových sekvencí, které by mohly ovlivnit a zablokovat každou interakci s potenciálními klinickými účinky. Metoda COMRADES proto otevírá dveře při navrhování nové generace antivirových léků na bázi RNA pro různorodý rozsah RNA virů v jakékoliv hostitelské buňce.

Dr. Ziv, postdoktor v laboratoři profesora Erica Miska v Institutu Gurdon, řekl: "Při technice COMRADES můžeme zkoumat podrobné molekulární interakce mezi virem a hostitelskou RNA, což nám umožní navrhnout krátké sekvence RNA nebo DNA, které mohou být podáním interferovat s těmito interakcemi - potenciálně bránící schopnosti viru replikovat a infikovat další buňky Informace získané od společnosti COMRADES otevírají dveře zcela novému způsobu řešení těchto virů.Vzhledem k široké škále použitelnosti této techniky na jakýkoli virus RNA a jakákoli hostitelská buňka mohou být cílem takového výzkumu jak virové, tak lidské RNA virové onemocnění. "

menu
menu